挂牌以来，福建自贸试验区平潭片区紧紧围绕 “一岛两窗三区”战略定位，按照省委、省政府决策部署，在海关、海事、边检、商务等部门的大力支持下，通过打通影响通关效率的堵点和痛点，创新通关便利化服务措施，努力打造“成本最低、通关最便捷、到货最准时、服务最配套、政策最优惠”的平潭模式。
截至今年5月，平潭口岸进口整体通关时间为7.62小时，出口整体通关时间为0.51小时，进出口通关时效位居福州关区前列，口岸整体通关时间迈入进口个位数和出口小数点时代。2018年“双十一”期间，平潭获全国菜鸟仓出货时效和通关效率“双料”第一。今年1—5月，平潭口岸出入境旅客人数同比增长44.1%；海运集装箱吞吐量同比增长50.6%，增速居全省第一。
源头采信，标准共通
充分发挥平潭沿海近台的区位和政策优势，按照“应通尽通”要求，实施“三互”通关改革，率先试点采认台湾地区相关标准。
信息互换。充分发挥全国唯一对台检验检疫数据交换平台功能和作用，全力推动“一张证书、两岸互认”，完成8家台湾企业171份电子证书交换试点。同时，通过“两岸海关电子信息交换系统”，实现原产地证书电子联网，节约证书寄送成本和在途时间，每票货物减少通过时间50%、节约通关成本8%。
监管互认。率先采信台湾检验检测和认证认可结果，与“台湾财团法人认证基金会”（TAF）及与“台湾标准检验局”合作，采信台湾白酒塑化剂检测结果、小家电BSMI证书，累计采信台湾白酒、小家电3055批、3.66亿元。对台湾和平潭之间航线的船舶采取两岸直航证书、船员证书互认，简化台湾船舶进出平潭手续，为船舶进出港提供便利。
执法互助。与台湾地区“防检局”等部门合作，对台湾食品、农产品采取“源头采信监管、口岸快速验放”快速通关政策，在质量安全源头管理基础上，实施入境口岸单证审核与查验，降低实验室检测比例。
信息共享，一窗通办
为加快通关速度，通过业务融合、单一窗口建设、流程精简等系列改革举措，实现“让数据多跑路，让企业少跑路”，为企业申报、人员出入境提供便利。
率先实施“关检合一”，加强业务融合。全省率先试点现场关检综合业务融合作业，将原来关检的10个窗口，通过合并、撤销等方式缩减至6个，让企业办理通关手续少跑腿、少交材料，不断提升企业改革获得感。
推行“单一窗口”，打通信息壁垒。取消纸质通关，全面实现通关全流程无纸化、3C免办业务全程电子化，并将报关单、报检单合二为一，申报项目由229个精简至105个。全面上线全国版检验检疫无纸化系统，精简333种单证，查验效率提高30%，取消通关单及92种纸制单证材料，梳理并缩减三分之一进出口环境验核监管证件。全国率先实施对外贸易经营者备案登记和原产地证备案登记“两证合一”，实现一次申报、一次放行。海事部门透过“单一窗口”平台，国际航行船舶进出口岸申报业务办理时间大幅缩短，由5个小时缩短至20分钟内。
创新实施“即办即通”，提升出入境效率。边检部门通过配置赴港澳台旅游自助加签一体机、自助通关人员信息备案采集室等便利服务窗口，为台胞提供一次性通行证件办证查验“同窗服务、即办即通”服务，为大陆旅客出境赴台游提供“现场加签、即办即通”服务，为自助通关人员提供信息采集备案服务“秒速通关、即办即通”服务，人员出入境整体通关效率提高20分钟以上，打造了无障碍、零等待的快速通关通道。
快速查验，快速审核
坚持以通关最快捷、成本最低为目标，通过优化服务、简化监管、采用新技术等方式实现快检快核，打造一流的通关环境。
通关服务前移。采取“人等船，证先办”、预检预查前置服务模式，前移业务科室一线驻勤，并建立“日监控、周通报、月评估”的发现、跟踪、预警机制，对未放行报关单实施跟踪分析，督促处置。推出通关预约微信平台，实行提前申报、预约加班，实现24小时通关服务，有效缩短船舶滞港时间。
简化监管方式。实施“边抽样送检，边上架销售”“台湾水果免于提交植物检疫证书”“台湾自捕水产品免于提交卫生检疫证书”等一系列便利化举措，实现台湾农渔产品3小时内便捷通关。推出“分类提前报关、实货船边验放”“理货管理、全程监控”等新模式，促进两岸小额贸易发展。优化快件通关流程，进一步取消理货程序，加快快件通关，降低物流运作成本。推动跨境电子商务“转关模式”转化为“全通模式”，可实现在货物转出地一体化放行，为企业节约了大量通关时间和成本。采认进出港台籍船舶技术证照，推动台湾船舶快速通关。实行免核查动植物检疫证书“正面清单”制度，对清单内产品减免随附资料，缩短了货物通关时间。
加大科技应用。开展区内货物电子转场监管作业，企业可以在抵达澳前客运码头前就通过海关信息化管理平台企业端提交转场申请单，在业务现场即可对货物物流信息进行实时查询、审核和处置，节约纸质转场单往来寄送时间。实施移动扫码支付征收进境物品行邮税业务，助推行邮税款支付进入“读秒时代”，平均单宗征税业务耗时减少60%。率先试点引入“智能审图”系统，推进福建省全球质量溯源体系在跨境电商、海运快件业务的应用，实现高效精准监管。建设海运快件数字档案管理系统，以加密电子数据存档替代纸质单证存档，可为每个货柜节省约两人次两天的工作量，有效提升工作效率。此外，还通过引进扫码快速查验技术，推动快件出口。
诚信通关，创新服务
通过强化组织保障，提供信用服务、企业承诺、担保等通关便利机制，建立以诚信和守法便利为核心的通关管理体系。
强化组织保障。成立压缩通关时间工作组，实行关长总负责，将责任落实到科到人，帮助协调困难解决问题。建立查验指令不过夜工作机制，成立业务突击队，全力保障台湾农渔产品、夜间到港对台小额贸易货物、跨境电商大促销商品快速通关。
提供便利化服务。对信用等级高的口岸企业、服务对象给予专员服务、优先办理等便利措施，对口岸限定区域通行许可一次申报、一次审批、全区通行。二是试行承诺制。简化审批流程，允许船长提交安全承诺并落实各项安全措施的条件下，对台直航船舶进出港时免引航员、免拖轮。
提供增值服务。实施关税保证保险制度，实现保证金向保险金的模式突破，降低了企业融资成本。扩大汇总征税适用范围以及提高电子支付、自报自缴、汇总征税比例，进一步突显“守法便利”原则。拓展银关保、银关融等担保创新项目，优化税款担保放行、延期、核销核批手续，减轻企业经营成本和资金压力，助力外贸综合服务企业发展。
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